NER on hematologic pathology notes
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BERT models for corpus validation as dscribed in our paper. • 3 items • Updated
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<PathologyFindingsAnnotation>
<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : In den ergänzenden Immunfärbungen zeigen die diffusen blastären Infiltrate eine homogene und kräftige Expression von CD20 und von CD10 in Abwesenheit von CD3, BCL-2 und TdT. Ihre Ki67-Proliferations... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Immunhistochemisch lassen sich hier im Interstitium kleine Gruppen von schwach CD20-positiven B-Zellen nachweisen. Diese Zellen zeigen eine Coexpression des PAX5, CD5, CD79und nukleär Cyclin D1.... |
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<TEXT><![CDATA[ In den ergänzenden Immunfärbungen sieht man im Knochenmark eine teils kleinstherdig akzentuierte interstitielle Infiltration durch Plasmazellen, die neben einer membranären Expression von CD138 weitestgehe... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : CD138 markiert die im Erstbericht beschriebenen atypischen Plasmazellen, deren Anteil am kernhaltigen Knochenmark ca. 60% beträgt. Somit handelt es sich hier um Infiltrate einer plasmazellulären Neo... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Wie angekündigt, wurden noch immunhistochemische Zusatzuntersuchungen veranlasst. Die Ergebnisse liegen nun vor: in der CD138 Reaktion sieht man dabei auch weiterhin lediglich einzelne eingestreute P... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Wie angekündigt, wurden noch immunhistochemische Untersuchungen veranlasst. Die Ergebnisse liegen nun vor. Die Plasmazellen sind negativ für CD 20, CD 22, CD30 und BRAF. c-MYC ist in etwa 50 % der Pl... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Die Anzahl von MUM1-positiven Plasmazellen liegt bei weniger als 3%. Die Plasmazellen zeigen eine polyklonale Leichtkettenexpression. Im vorliegenden Material kein Nachweis von Infiltraten eines ... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Wie angekündigt, wurden noch immunhistochemische Zusatzuntersuchungen veranlasst. Die Ergebnisse liegen nun vor: der Gehalt an CD34- und CD117-positiven Blasten überschreitet dabei nicht 1 % aller ke... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Immunhistochemisch zeigen sich gering vermehrte, teils in kleinen Grüppchen gelagerte, ca. 10% aller kernhaltigen Knochenmarkszellen ausmachende, MUM-1-positive Plasmazellen mit Restriktion für die L... |
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<TEXT><![CDATA["NACHBERICHT : In den immunhistochemisch gefärbten Paraffinschnitten sieht man im Knochenmark disseminiert verteilte, singulär gelegene und quantitativ nicht abnorm vermehrte, CD34-positive Blasten (anteilig < 5 % ... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : In den ergänzenden Immunfärbungen zeigt sich mikroskopisch, dass die ausgedehnten und überwiegend diffusen neoplastischen Infiltrate eine homogene und kräftige Expression von CD20, PAX5, Cyclin D1 u... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : Wie angekündigt, wurden noch immunhistochemische Zusatzuntersuchungen veranlasst. Die Ergebnisse liegen nun vor: die vorbeschriebene blastäre Zellpopulation ist dabei kräftig positiv für die myeloisc... |
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<TEXT><![CDATA[['NACHBERICHT : Zwischenzeitlich liegen die immunhistochemischen Zusatzuntersuchungen vor. Die vorbeschriebenen Infiltrate zeigen hierbei eine Coexpression von CD20, PAX5, BCL6 und BCL2, außerdem partiell (etwa 60... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : In den immunhistochemisch gefärbten Paraffinschnitten zeigt sich mikroskopisch, dass die blastären Infiltrate homogen CD34, nahezu homogene CD117, zu weniger als der Hälfte und in teils kleinherdig ak... |
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<TEXT><![CDATA[NACHBERICHT : In den immunhistochemisch gefärbten Paraffinschnitten sieht man im Knochenmark atypiefreie, quantitativ nicht abnorm vermehrte und zumeist disseminiert verteilte Lymphozyten, unter denen in orthologer... |
This data set contains annotated samples of pathology nodes as described in our manuscript. They are part of the corpus that was used to train the models. We recommend using MedTator for viewing the files along with the dtd file published here.
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